Séries ST2S, STL biotechnologies

le BTS ABM du Lycée Littré, fil rouge d'une émission TV !

Marianne BARAILLE — 2020-10-08T18:13:28Z

Ce jeudi 01 octobre 2020, la section BTS Analyses de Biologie Médicale (ABM) a été le fil rouge de l'émission « Ensemble c'est mieux » sur France 3 Normandie.

L'équipe de tournage, l'équipe pédagogique et les étudiants du BTS ABM

Depuis 2017, le lycée E. Littré d'Avranches (Manche) a ouvert un BTS Analyses de Biologie Médicale (ABM) permettant de former chaque année 15 techniciens supérieurs directement opérationnels après leur deux années d'études et leurs deux stages de 6 semaines chacun en milieu médical.

Ils trouveront un poste sur les plateformes d'analyses de biologie médicale, en laboratoire privé ou à l'hôpital, dans les laboratoires des établissements français du sang (EFS), les laboratoires d'analyses vétérinaires…
Ce métier primordial pour le bien être de tous : suivi de pathologies chroniques, diagnostic de pathologie, suivi de grossesse… est malheureusement mis à l'honneur à cause de la crise sanitaire de la Covid-19 qui secoue le monde.

Si vous n'avez pas eu la chance de voir l'émission en direct, rattrapez vous sur le replay, disponible en cliquant ici

Les 15 premières minutes de l'émission ainsi qu'un focus de quelques minutes à partir la 31ème minute vous seront très utiles pour comprendre les compétences mobilisées et les attendus du BTS ABM.

Un incontournable pour l'aide à l'orientation !

L'équipe pédagogique du BTS ABM du lycée E. Littré

Recommandations 3RB-covid19

Marianne BARAILLE — 2020-08-31T21:59:09Z

COVID19-coronavirus : comprendre le risque bio
par Amandine GUILLOUX

https://www.youtube.com/watch?v=PVq...

Le site Eduscol Biotechnologies/STMS publie un document de 6 pages présentant des recommandations pour limiter le risque biologique lié à la crise sanitaire Covid19 lors des manipulations en laboratoire de biotechnologies en STL biotechnologies et BTS de biologie appliquée.
Ce document est proposé par l'inspection générale de biotechnologie biochimie génie biologique et le réseau ressource risque biologique (3RB).
Lien vers l'article sur Eduscol

Ce document est téléchargeable ici

Recommandantions Manipulations en laboratoire/Covid19

Vous y trouverez également une vidéo conçue par deux enseignantes de biotechnologies biochimie génie biologique (BGB), Sabine Orsoni et Amandine Guilloux, avec le concours des corps d'inspection, pour expliciter la chaine de transmission et les moyens de prévention liés à cette épidémie.
Lien vers la vidéo

Des bonbons au laboratoire !

N Bergère — 2012-05-31T13:37:14Z

Des confiseries gélifiées en forme d'ourson très appréciées des enfants ont la composition suivante :
« Sirop de glucose, Sucre, Gélatine, Acidifiant : acide citrique, Dextrose, Jus de fruits concentrés, Arômes »

Trois objectifs de séquences au laboratoire sont définis :

application de la chromatographie d'exclusion moléculaire à la séparation des constituants du bonbon gélifié avec contrôle de l'efficacité de la séparation par le dosage des protéines et du glucose,
dosage de l'acidité du bonbon
contrôle de la composition en sucres et en protéines de ces confiseries annoncée sur l'emballage :

Protéines	6,2 g pour 100 g
Sucres	78 g pour 100 g

La gélatine est une protéine animale extraite, après hydrolyse, de matières premières riches en collagène.

Trois matières premières sont utilisées pour obtenir industriellement la gélatine :
Les couennes de porc toujours traitées par hydrolyse acide et conduisant donc à des gélatines de type A,
Les peaux de bovin toujours traitées par hydrolyse alcaline et conduisant donc à des gélatines de type B,
Les os qui peuvent être de type A ou B.

Que l'hydrolyse ait été réalisée en milieu acide ou en milieu alcalin, la gélatine est ensuite extraite à l'eau chaude à des températures croissantes.
Viennent alors des opérations de filtration, désionisation, concentration, stérilisation, gélification, extrusion, séchage, et broyage permettant d'obtenir le produit fini.

Procédés de fabrication de la gélatine alimentaire (source Adrianor)

Après dissolution dans l'eau chaude et refroidissement, la gélatine forme un gel qui présente de nombreux avantages pour des applications alimentaires :

il est très clair, et cette transparence est recherchée notamment dans les confiseries,
il est réversible, c'est à dire qu'il fond lorsqu'il chauffe au delà d'une température dite point de fusion qui se situe entre 27 et 35°C, ce qui est intéressant quand on recherche une fusion en bouche.

La formation du gel va dépendre :
de la gélatine elle-même (degré bloom),
de la durée et de la température : le gel se forme immédiatement à 10°C, mais il faut environ 16 heures pour atteindre la gélification maximale,
et de la concentration en gélatine : elle doit être de 0,8 % minimum pour qu'il y ait gélification, c'est ce qu'on appelle la concentration critique de gélification.

Exemples d'utilisation de la gélatine :

Un grand nombre de produits alimentaires contiennent de la gélatine. Elle est utilisée comme épaississant, stabilisant ou agent texturant dans des produits comme les confiseries, les crèmes glacées, les confitures, les yaourts, la margarine, les gateaux… Elle est également utilisée dans les produits allégés pour stimuler la sensation de gras en bouche et créer du volume sans ajouter de calories.
Dans l'industrie pharmaceutique, la gélatine est l'un des principaux constituants des gélules contenant des médicaments. Dans l'industrie cosmétique elle fait partie de la composition de certaine crème.

Séparation des constituants du bonbon gélifié par chromatographie d'exclusion moléculaire

La gélatine alimentaire utilisée pour la préparation de ces confiseries est le seul constituant macromoléculaire entrant dans la composition. Il est donc possible d'effectuer la purification de la gélatine de l'échantillon par chromatographie d'exclusion moléculaire (ou gel-filtration) sur gel de Séphadex® G-25.

Le domaine de fractionnement de ce gel est de 1000 à 5000 g/mol. La gélatine sera donc totalement exclue de ce gel alors que les autres molécules suffisamment petites (glucose, saccharose, acide citrique…) pourront pénétrer dans les mailles du réseau moléculaire du gel et parcourront un chemin plus long que les grosses molécules de gélatine qui ne pénètrent pas dans le gel : toutes ces petites molécules seront donc éluées plus tardivement.

Principe de la chromatographie d'exclusion

Ce type de chromatographie est encore appelé : tamisage moléculaire, gel-filtration ou perméation de gel.

Cette technique permet la séparation des molécules en fonction de leur taille et de leur forme. On utilise pour cela des granules de gel poreux.

Les grosses molécules (dont le diamètre est supérieur à celui des pores) sont exclues et sont donc éluées les premières, au niveau du volume mort ( Vm ou V0 ). Les petites et moyennes molécules sont éluées plus tardivement, car incluses dans le gel, leur migration est freinée.

Les solutés sont donc élués dans l'ordre inverse des masses moléculaires. Il existe une relation linéaire entre le volume d'élution et le logarithme de la masse moléculaire.

Voici deux animations expliquant le principe de la chromatographie d'exclusion :

source : http://www.geniebio.ac-aix-marseille.fr/bioch/docs/tamisage.html

source : http://www.austincc.edu/biocr/index.html

Séparation des constituants des bonbons

Fiche protocole n°1	Fiche protocole n°2	Fiche technique GE Healthcare
Préparation de l'échantillon pour les analyses	Séparation de la gélatine par exclusion moléculaire	Colonne HiTrap Desalting

Dosage de la gélatine et des sucres des bonbons et obtention du profil chromatographique

Fiche protocole n°3	Fiche protocole n°4	Fiche technique BioMérieux
Dosage de la gélatine par la méthode de Biuret	Dosage du glucose par méthode enzymatique en point final	Kit RTU Glucose

Analyses possibles autour des manipulations :

En utilisant l'outil informatique, tracer la courbe d'étalonnage A lue à 540 nm = f ( masse de gélatine dans tube ).
Valider les points expérimentaux et donner les paramètres de la droite de régression.
Calculer la concentration en gélatine de l'échantillon « B ».
En déduire la teneur des bonbons gélifiés en pourcentage en masse et comparer à la valeur annoncée.
Tracer le profil d'élution de la gélatine.
Calculer la masse de gélatine récupérée dans chaque fraction analysée.
En déduire le rendement de récupération de la gélatine au cours de la chromatographie.
Calculer la concentration en glucose de l'échantillon « B ».
Grâce au dosage de l'hydrolysat « H », calculer la concentration en saccharose de l'échantillon « B ».
En déduire la teneur en glucose et saccharose des bonbons gélifiés en pourcentage en masse et comparer à la valeur annoncée.*
Tracer le profil d'élution du glucose.
Calculer la masse de glucose récupérée dans chaque fraction analysée.
En déduire le rendement de récupération du glucose au cours de la chromatographie.
Analyser le profil d'élution ci-dessous :

Dosage volumétrique d'un polyacide : l'acide citrique

Fiche technique n°5

Production de GFP par E Coli

F Colomb — 2011-03-27T18:01:01Z

Le but de la manipulation est de transformer une souche d'E Coli K12 avec un plasmide (pGLO) contenant deux gènes d'intérêts, l'un pour la sélection et l'autre pour la mise en évidence de la transformation par synthèse de GFP :
un gène de résistance à l'ampicilline ;
un gène codant pour la GFP.

La GFP synthétisé sera ensuite extraite par chromatographie (TP2) puis caractérisé par électrophorèse (TP3)

Eléments de Principe

Principe de la production de GFP par E Coli

Protocole de TP

Transformation d'Ecoli K12 par le plasmide pGLO

Exemples de questionnement

Autour du principe :

Définir un plasmide
Définir la transformation
Justifier la composition du milieu de transformation
A quoi sert le choc thermique
Quels sont les caractères acquis par les bactéries transformées ?
Citer les deux autres types de transferts de matériels génétiques

Autour de la manipulation

Questionnement préalable

Quels résultats attendez vous ?

Plasmide	+pGLO	+pGLO	-pGLO	-pGLO
Milieu de culture	LB/amp	LB/amp/ara	LB/amp	LB
Résultats attendus

Sur quel(s) milieu(x) allez vous trouver des colonies de E Coli semblables à celles initialement utilisées pour la transformation ?
Sur quelle(s) boite(s) de Pétri allez vous trouver des cellules bactériennes transformées ?
Quels milieux pourront être comparés pour déterminer si une transformation bactérienne a bien eu lieu ?
Quelles différences observez vous entre les résultats des boites +pGLO/LB/amp et +pGLO/LB/amp/ara ?
Quelles sont les boites de Pétri qui servent de contrôle dans ce test ? Que contrôlent-elles ?

Analyses des résultats obtenus

Dresser un tableau de résultats en indiquant le nombre, la couleur, la fluorescence des colonies.
Décrire l'observation de la solution plasmidique pGLO
Quel est le nombre total de cellules fluorescentes déposées sur le milieu +pGLO/LB/amp/ara ?
Sachant que sur ce milieu l'équivallent de 0,16µg d'ADN plasmidique ont été déposé, calculer l'efficacité de la transformation (Nbre de transformation/µg d'ADN)

Détermination de la masse moléculaire de la GFP

F Colomb — 2011-01-26T15:13:50Z

Cet article fait partie du dossier « Détermination de la masse molaire de la GFP », mise en oeuvre dans le projet européen Comenius « The game of protein ».

Voici en quelques diapos et vidéos une présentation de la manipulation de détermination la masse moléculaire de la GFP

Récupération de la plaque de gel Préparation de la plaque de gel Préparation de la cuve d'électrophorèse Remplissage de la cuve d'électrophorèse Remplissage des puits du gel Mise en route de l'électrophorèse Démoulage du gel

Les OGM

F Colomb — 2010-10-14T14:24:43Z

Dans le cadre de la fête de la science 2010 dont le thème principal concernait la biodiversité, les étudiants de 2ème année du BTS Bioanalyses et Contrôles du lycée Léopold Sédar Senghor d'Evreux ont réalisé une série d'affiche sur le thème des OGM.

Ces affiches ont été présentées dans le cadre du village des sciences d'Evreux.

Une première affiche présente ce qu'est la molécule d'ADN, sa localisation cellulaire et son principal rôle	Qu'est ce que l'ADN ?
Une seconde explique sur un exemple type, comment peut-on obtenir un OGM par les techniques les plus courantes	Techniques d'obtention des OGM
Une troisième donne un certain nombre d'exemples d'applications des OGM dans des domaines aussi variés que la santé, l'agriculture, l'environnement....	Applications des OGM
Une quatrième fait un inventaire rapide de l'utilisation des OGM dans le monde en présentant les principales cultures de plantes génétiquement modifiées et les principaux pays producteurs	Les OGM dans le monde
Une cinquième présente succinctement quelques techniques de détection des OGM utilisées en particulier par les organismes de contrôle	Techniques de détection des OGM
Enfin une dernière montre comment il est possible très simplement de produire un OGM dans un laboratoire d'enseignement...	Exemple de la production d'un OGM au lycée Senghor

Chacun de ces documents peut être téléchargé au format imprimable (pdf) au bas de cet article.

Les glucides

N Bergère — 2010-01-24T16:11:04Z

Voici un cours sur les glucides destiné aux étudiants de BTS et plus particulièrement à ceux de BTS BioAnalyses et Contrôles.

INTRODUCTION

Aspect quantitatif
Aspect qualitatif
Classification

Sous chapitre 1 : STRUCTURE DES OSES

I . PRESENTATION GENERALE DES OSES

1° ) Définition
2° ) Classification

II . ISOMERIE DES OSES

1° ) Définition générale
2° ) Exemple du glycéraldéhyde
3° ) Pour les autres oses

III . NOMENCLATURE D ET L ET FILIATION DES OSES

1° ) Série D et série L
2° ) Filiation des aldoses
3° ) Filiation des cétoses
4°) Remarque : Ecriture simplifiée de Reichstein

IV . STRUCTURE CYCLIQUE DES OSES

1° ) Anomalies de la forme linéaire
2° ) Cyclisation des aldoses
3° ) Cyclisation des cétoses
4° ) Les principaux oses et leur état naturel
5° ) Conformation des formes cycliques

V . LES PRINCIPAUX OSES ET DERIVES D'OSES

1° ) Oses couramment rencontrés
2° ) Les dérivés d'oses

Voir la structure des oses - Cliquer sur la vignette

PROPRIETES DES OSES

I . PROPRIETES PHYSIQUES DES OSES

1° ) Pouvoir rotatoire
2° ) Indice de réfraction

II . PROPRIETES CHIMIQUES DES OSES
1° ) Pouvoir réducteur des oses
2° ) Autres propriétés de la fonction hémiacétalique
3° ) Propriétés dues aux fonctions alcool
4° ) Autres propriétés

Voir les propriétés des oses - Cliquer sur la vignette

LES OSIDES

I . LA LIAISON OSIDIQUE

1° ) Définition
2° ) Les différents types de liaisons osidiques entre 2 oses
3° ) Nomenclature et convention
4° ) Méthodes d'étude de la liaison osidique

II . LES PRINCIPAUX DIHOLOSIDES

1° ) Les diholosides réducteurs
2° ) Les diholosides non réducteurs
3° ) Les disaccharidases
4° ) Autres oligoholosides

III . LES POLYHOLOSIDES

1° ) L'amidon
2° ) Le glycogène
3° ) La cellulose
4° ) Les autres ployholosides

IV . LES HETEROSIDES

1° ) Les hétéro-oligosides
2° ) Les glycoconjugués

Voir les osides - Cliquer sur la vignette

PRINCIPALES METHODES D'ANALYSE DES GLUCIDES

I . EXTRACTIONS SELECTIVES

1° ) Oses et oligosides
2° ) Les polyosides

II . FRACTIONNEMENT ET IDENTIFICATION

1° ) Fractionnement
2° ) Identification

III . DOSAGE DES OSES ET OSIDES

1° ) Méthodes physiques
2° ) Méthodes chimiques
3° ) Méthodes enzymatiques

IV . DETERMINATION DE LA STRUCTURE DES OSIDES

Voir les principales méthodes d'études des glucides - Cliquer sur la vignette

EXERCICES D'APPLICATION

Ouvrir les exercices d'application - Cliquer sur la vignette

TP de systématique bactérienne

F Colomb, O Beaumesnil — 2010-01-23T15:37:29Z

Vous trouverez dans cette article un certain nombre de protocole de TP sur la systématique bactérienne.

Démarrons par une introduction à la systématique bactérienne et découvrons les grands groupes bactériens

Objectif :

Aperçu général des différents groupes bactériens

Intéressons nous maintenant aux bacilles Gram négatif non exigeants et aérobies

Objectif :

Connaissance du groupe des bacilles à Gram négatif : étude des caractères différentiels entre les Enterobacteriaceae, le genre Vibrio et apparentés et le genre Pseudomonas et apparentés.

Les Entérobactéries (1ère partie) : identification bactérienne jusqu'au genre et /ou à l'espèce à l'aide d'une macrogalerie

Objectifs :

Mettre en évidence les caractères morphologiques, culturaux et biochimiques pour orienter l'étude vers la famille des entérobactéries.
Réaliser l'ensemencement d'une galerie traditionnelle d'identification en tubes (= macrogalerie)
A l'aide des tableaux dichotomiques, identifier le genre voire l'espèce de la bactérie donnée.

Les Entérobactéries (2ème partie) : identification bactérienne jusqu'au genre et /ou à l'espèce à l'aide d'une microgalerie

Objectifs :

Mettre en évidence les caractères morphologiques, culturaux et biochimiques pour orienter l'étude vers la famille des entérobactéries.
Réaliser l'ensemencement d'une galerie miniaturisée d'identification en plaque (= microgalerie)
A l'aide des tableaux dichotomiques, d'identification et du catalogue analytique, identifier l'espèce de la bactérie donnée.

Les Entérobactéries (3ème partie) : les Entérobactéries lactose + : l'exemple des coliformes

Objectifs :

Mettre en évidence les caractères morphologiques, culturaux et biochimiques pour orienter l'étude vers la famille des entérobactéries.
Réaliser l'ensemencement d'une macrogalerie en vue de la détermination de l'espèce du coliforme.
A l'aide du tableau dichotomique, identifier l'espèce du coliforme donné.
Réaliser, interpréter et conclure un test de Mackensie.

Les Entérobactéries (4ème partie) : les Entérobactéries lactose - : les genres Salmonella et Shigella ainsi que les entérobactéries DA +

Objectifs :

Mettre en évidence les caractères morphologiques, culturaux et biochimiques pour orienter l'étude vers la famille des entérobactéries.
Réaliser l'ensemencement d'une macrogalerie en vue de la détermination de l'espèce de l'entérobactérie lactose - .
A l'aide du tableau dichotomique, identifier l'espèce de l'entérobactérie lactose - .

Les Entérobactéries (5èmepartie) : le sérotypage de Salmonelles et le test de l'uréase rapide

Objectifs :

Reconnaître des colonies suspectes sur milieu sélectif spécifique
Mettre en oeuvre un test d'orientation rapide vers le genre Salmonella
Identifier la bactérie suspecte suite au résultat de l'uréase rapide par ensemencement d'une galerie réduite
Déterminer le sérotype d'une salmonelle identifiée biochimiquement par la technique du sérotypage

Intéressons nous maintenant aux genres Pseudomonas et apparentés

Objectifs :

Exploiter les caractères de différenciation des genres pour orienter l'identification.
Identifier l'espèce bactérienne grâce à la galerie biochimique.

Enfin terminons par l'étude des genres Vibrio et apparentés

Objectifs :

Exploiter les caractères de différenciation des genres pour orienter l'identification.
Identifier l'espèce bactérienne grâce à la galerie biochimique et au tableau biochimique

TP d'introduction à la microbiologie

F Colomb, O Beaumesnil — 2010-01-23T15:00:49Z

Vous trouverez dans cette article un certain nombre de protocole de TP d'introduction à la microbiologie.

Démarrons par le microscope photonique (1ère partie) :

description
utilisation
et entretien

Objectifs :

Décrire les éléments du microscope optique et en expliquer les rôles
Définir les termes de grossissement, grandissement et pouvoir séparateur
Utiliser et entretenir correctement le microscope

le microscope photonique (2ème partie) :

Objectifs :

Mesurer un champ microscopique à différents grossissements (x 100, x 400, x 1000)
Définir la microscopie en contraste de phase, fond noir et en lumière UV
1er jour

Découvrons ensuite la diversité du monde microbien par l'observation
microscopique de différents micro-organismes

Objectifs :

Respecter les règles de sécurité, savoir organiser sa paillasse et
maîtriser la manipulation aseptique
Réaliser un frottis et une coloration au bleu de méthylène
Observer, décrire et comparer plusieurs types de cellules
Evaluer la taille de micro-organismes dans un champ microscopique

Réalisons des examens microscopiques : coloration de
Gram et état frais

Objectifs :

Savoir réaliser une préparation microscopique colorée par la
technique de Gram
Savoir différencier des bactéries à Gram positif des bactéries à Gram
négatif
Déterminer le principe de la coloration de Gram
Savoir réaliser une suspension bactérienne
Savoir réaliser un état frais et comprendre son interprétation

Réalisons des techniques d'ensemencements et des examens
macroscopiques des cultures bactériennes

Objectifs :

Connaître les techniques d'ensemencement (GN, GNi, BN)
Déterminer l'intérêt d'un isolement
Savoir décrire les caractères macroscopiques en milieu liquide et sur gélose inclinée solide
Savoir décrire une colonie isolée sur gélose nutritive en boîte de Pétri
Savoir mettre en relation des résultats de l'observation macroscopique des colonies avec les examens microscopiques réalisées sur cette souche.

Découvrons les caractères culturaux des bactéries

Objectifs :

Connaître différentes conditions de culture et déterminer leur intérêt
Connaître différents milieux de culture et déterminer leur intérêt

Enfin, intéressons nous aux métabolismes énergétique et glucidique des bactéries

Objectifs :

Connaître les techniques d'étude de la respiration bactérienne grâce aux méthodes d'étude des métabolismes énergétique et glucidique
Mettre en oeuvre des différentes techniques permettant d'étudier le métabolisme glucidique

1ère partie
2ème partie

Détermination de KM et Vmax

F Colomb — 2010-01-21T15:23:35Z

Détermination de KM et Vmax

Exemple de la phosphatase alcaline